L'ITMO Cancer d'Aviesan finance des projets de recherche sur le cancer dans le cadre de programmes d’organismes partenaires :
programme national de recherche en environnement-santé-travail (PNR-EST) de l’Anses (Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail), depuis 2011 ;
équipes françaises de l’ICGC (International Cancer Genome Consortium) ;
programme HPV (Human Papilloma Virus) et cancer de l'Institut de recherche en santé publique (IreSP), en 2018 ;
programme ATIP/Avenir du CNRS et de l’Inserm, depuis 2007 ;
postes d'accueil de l'Inserm, en 2018 ;
programme Jeunes chercheurs ou jeunes chercheuses (JCJC) de l'ANR (Agence nationale de la recherche), depuis 2020 ;
thèses interdisciplinaires d'écoles doctorales : FdV (Frontières du vivant, université Sorbonne Paris-Cité) depuis 2010 ; STIC (Sciences et techniques de l'information et de la communication, université Paris-Saclay) depuis 2018.
